Sanal mağazalar için özel arayüz tasarımları yapılması ve bu tasarımların sanal mağaza için kodlanması aylarca süren bir çalışma gerektirmektedir. Tasarım sırasında ihtiyaç olmayan bir özelliğin tasarımı yapılmadığı durumda, ilerleyen zamanlarda kullanılmak istendiğinde ise, standart olarak kalmış özellik yeni tasarımla uyum sağlayamamakta ve yeniden bu özellik için tasarım çalışma ve kodlama ihtiyacı ortaya çıkmaktadır. Hem daha çok zaman, hem daha çok maliyet hem de çok fazla test gerektiren bu çalışmalar sanal mağaza işletmecilerinin en çok yorulduğu konulardan olmaktadırlar.